नासरत के यीशु के जीवन के अंतिम 12 घंटों के बारे में फिल्म, मसीह का जुनून बिल्कुल बाइबिल की सच्चाई का सम्मान करता है। फिल्म गेतसेमाने के बगीचे में शुरू होती है, जहां, वह प्रार्थना करने के लिए पीछे हट जाता है, अंतिम भोज के बाद, यीशु शैतान के प्रलोभनों का विरोध करता है। यहूदा इस्करियोती द्वारा धोखा दिए जाने के बाद, मसीह को गिरफ्तार कर लिया जाता है और यरूशलेम शहर में ले जाया जाता है, जहाँ फरीसी याजकों ने उस पर ईश निंदा का आरोप लगाया है, ऐसे आरोप जो उसकी मौत की सजा लाएंगे।
यीशु को फिलिस्तीन के रोमन गवर्नर पोंटियस पिलातुस के सामने ले जाया जाता है, जो फरीसियों द्वारा उसे लगाए गए आरोपों को सुनता है। यह जानते हुए कि वह एक राजनीतिक संघर्ष का सामना कर रहा है, पिलातुस ने समस्या का समाधान राजा हेरोदेस पर छोड़ दिया। वह यीशु को पिलातुस के सामने वापस लाता है, जो यीशु और हत्यारे बाराबास के बीच निर्णय लेने के लिए भीड़ को निर्धारित करता है। जनता बाराबास को रिहा करने और यीशु की निंदा करने का विकल्प चुनेगी।
मसीह को रोमन सैनिकों के सामने आत्मसमर्पण कर दिया जाता है और उसे सताया जाता है। पहचानने योग्य नहीं है, उसे पिलातुस के सामने वापस लाया जाता है, जो उसे भीड़ को दिखाता है, कहता है, ‘क्या यह पर्याप्त नहीं है? यह पर्याप्त नहीं है … पिलातुस अपने हाथ धोता है और सैनिकों को आदेश देता है कि वे वही करें जो भीड़ की मांग है।
यीशु को क्रूस लाया जाता है और इसे यरूशलेम के माध्यम से कलवरी ले जाने का आदेश दिया जाता है, जहां उसे क्रूस पर चढ़ाया जाता है। यहाँ वह अंतिम प्रलोभन का सामना करता है – डर है कि उसे उसके पिता ने छोड़ दिया है। लेकिन जब वह पवित्र कुंवारी मरियम को देखता है, तो वह उस पर काबू पा लेता है, और कुछ ऐसा कहता है जिसे केवल वह ही पूरी तरह से समझ सकती है: ‘प्रतिबद्ध।
उसकी मृत्यु के समय, प्रकृति स्वयं विद्रोह करती है।